Introducción:

Proteus mirabilis es un patógeno oportunista, naturalmente resistente a polimixinas, tetraciclinas y tigeciclina. La resistencia a carbapenemes incluye la reducción de la permeabilidad y la producción de carbapenemasas. La incidencia de este patógeno en el hospital analizado es escasa.

Objetivos:

Aquí se describe el aumento en la incidencia de infecciones por P. mirabilis productores de metalo-carbapenemesa (MBL), durante el periodo de noviembre 2020 a marzo 2021, en el contexto de la pandemia de COVID-19 y se caracteriza un aislamiento representativo (Pm21) con secuenciación de genoma completo (SGC).

Materiales y Métodos:

Se recuperaron 82 aislamientos de P. mirabilis productores de MBL de 40 pacientes internados. La identificación y la sensibilidad a los antibióticos se efectuaron por Vitek-MS® y Vitek2® (BioMérieux). 26 aislamientos representativos de la evolución temporal fueron tipificados por REP y ERIC-PCR. En todos se corroboró la presencia de blaNDM-5 y blaCTX-M-15 por PCR y secuenciación. La SGC de Pm21 se realizó en la plataforma Illumina NextSeq. Las lecturas se ensamblaron de novo con Unicycler Version 0.5.0 y se analizaron utilizando herramientas bioinformáticas.

Resultados:

El 46,2% de los aislamientos correspondieron a pacientes internados por COVID-19, 26,8% a otras patologías. En el 20,8% no pudo asignarse motivo de internación. La media de edad fue 50 años (rango 45-90). Los 82 aislamientos fueron resistentes a AMP, AMS, PIP/TAZ, CFZ, CRO, CAZ, FEP, IMI, MER, AMK, GEN, CIP y TMS. Todos presentaron sinergia IMP-EDTA-MEM. Los 26 aislamientos representativos dieron el mismo perfil de bandas por REP y ERIC-PCR, indicando que se encontraban estrechamente relacionados. La SGC reveló un genoma de 4.284.373 pb, con un GC del 39.1%, se obtuvieron 197 contigs y un valor N50 de 140.806 pb. El análisis del resistoma predijo la presencia de varios genes de resistencia antimicrobiana adquiridos, como rmtB, aadA1, aph(4)-Ia, aph(3”)-Ib, aac(3)-IV, aph(3′)-Ia, aph(6)-Id, aadA2b, aac(3)-IId (resistencia a aminoglucósidos), dfrA32 y dfrA17 (resistencia a trimetoprima), blaNDM-5, blaCTX-M-15, blaOXA-1, blaOXA-2 y blaTEM-1B (resistencia a β-lactámicos), sul1 y sul2 (resistencia a sulfonamidas). No se encontraron grupos de incompatibilidad plasmídicos.

Discusión / Conclusiones:

Desde que el gen blaNDM fue identificado inicialmente en India en 2009, se ha propagado rápidamente por todo el mundo. La co-transferencia de múltiples genes de resistencia a antibióticos de último recurso, como los carbapenemes y la amikacina requiere de sistemas de vigilancia constante.