Introducción:
Achromobacter spp. son bacilos gram negativos no fermentadores, aerobios, ampliamente distribuídos en el entorno. Se caracterizan por presentar resistencia a múltiples antimicrobianos, sin embargo, poco se conoce acerca de los mecanismos involucrados, en especial en especies distintas de A. xylosoxidans.
Objetivos:
Evaluar la presencia de diferentes determinantes de resistencia en Achromobacter insuavis ST535 productor de brote y pseudobrote nosocomial en CABA, Argentina.
Materiales y Métodos:
La sensibilidad a antimicrobianos se realizó de acuerdo a las recomendaciones del CLSI. NGS se realizó mediante NextSeq500 con PE de 150 pb y se efectuó el ensamblado de novo utilizando Unicycler (Galaxy). Se utilizaron el servidor RAST y el software BLAST para predecir y confirmar todas las secuencias codificantes. La presencia de determinantes de resistencia se evaluó mediante Resfinder, CARD y curación manual; y la identificación de elementos genéticos móviles se realizó utilizando las bases de datos ISFinder, PlasmidFinder y PHASTER.
Resultados:
A. insuavis presentó resistencia a cefalosporinas de tercera y cuarta generación, aminoglucósidos, fluoroquinolonas, colistina. En el genoma se encontraron secuencias codificantes de: 5 -lactamasas “putativas” (- blaOXA-243 previamente reportado como marcador específico de A. insuavis; – 1 ß-lactamasa putativa de clase molecular A y 3 de clase C), 30 bombas de eflujo, 1 enzima modificadora de aminoglucósidos, 1 dihidropteroato sintasa y mutaciones en gyrA, gyrB, parC, parE (según Furlan et al. 2018). No se encontró en el genoma blaAXC, descripta en A. xylosoxidans y A. ruhlandii como carbapenemasa. Se detectaron secuencias completas para 4 bombas de eflujo RND (AxyABM, AxyXY-OprZ, Axy EF-OprN y el homólogo de mexCD-oprJ de P. aeruginosa). Se detectaron 11 genes codificantes de proteínas putativas de membrana externa. No se encontraron genes homólogos a OprD de P. aeruginosa. Mediante curación manual se detectaron genes con un bajo porcentaje de identidad (35%) con phoQ y pmrB, y secuencias codificantes para la glicosil transferasa ArnC, implicados en la resistencia a colistina en P. aeruginosa y E. coli. Se encontraron IS pertenecientes a las familias Tn3, IS1, IS3, IS4, IS5, ISNCY. Se identificaron 5 regiones de profagos, de las cuales 2 se encuentran intactas. No se detectaron plásmidos.
Discusión / Conclusiones:
Se logró identificar una gran cantidad de genes determinantes de resistencia que ameritan más estudios por su participación en la resistencia en esta especie. Es posible inferir que la resistencia a los antimicrobianos involucra tanto a modificaciones en los blancos moleculares como bombas de eflujo y mecanismos enzimáticos.
