Introducción:

Con la llegada de SARS-COV2 a la Argentina y las olas de contagios que se produjeron, la adquisición de los reactivos necesarios para la extracción del RNA viral y la posterior amplificación/detección por métodos de PCR en tiempo real se vio afectada por la alta demanda. La situación nos obligó a trabajar con diversos proveedores. Los CCE son considerados la mejor estimación del valor verdadero, particularmente los controles de CAP poseen un elevado número de participantes que les otorgan robustez. Por esto tienen el peso estadístico para ser considerados material de referencia y nos permite utilizarlos en la comparación entre las diferentes combinaciones de reactivos.

Objetivos:

Comparar cualitativamente y cuantitativamente los resultados obtenidos en la detección de los CCE de CAP por medio de PCR en tiempo real para SARS-COV2, utilizando diferentes métodos de extracción de RNA y kits de amplificación/detección.

Materiales y métodos:

El 1er envío de CAP para SARS-COV2 del 2020 está compuesto tres niveles de control: COV2-01, COV2-02, COV2-03. Se obtuvo el RNA utilizando 3 kits diferentes: Magna Pure 96 (Roche), High Pure Viral (Roche), Quik RNA (Zymo). Cada eluato fue procesado por 4 kits de amplificación/detección diferentes: Anatolia (Targets: E, Orf1ab), Viasure (Targets: N, Orf1ab), Roche (Target: E), CDC (Target: N1, N2). Criterios de aceptación: Cualitativa: Resultado del laboratorio debe ser igual al resultado mayoritario informado por CAP. Cuantitativa: La diferencia entre los CT obtenidos en las diferentes combinaciones debe ser menor a 1.66 CT.

Resultados:

COV2-01 fue informado detectable por el 96,3% de los participantes en CAP. Resultado del laboratorio: Detectable por todas las combinaciones. COV2-02 fue informado no detectable por el 98,6% de los participantes en CAP. Resultado del laboratorio: No Detectable por todas las combinaciones. COV2-03 fue informado detectable por el 96,8% de los participantes en CAP. Resultado del laboratorio: Detectable por todas las combinaciones. Todos los CTs obtenidos cumplen con el criterio de aceptación establecido.

Discusión / Conclusiones:

Los resultados informados por el laboratorio son comparables a los resultados informados por CAP independientemente del kit de extracción y amplificación/detección que se utilice para obtenerlos y la diferencia de CTs entre las combinaciones fue menor a 1.66. Los resultados obtenidos conservan la utilidad clínica en todas las combinaciones de reactivos utilizadas.