Objetivo

Determinar la frecuencia relativa de bacterias aisladas de muestras respiratorias y de sus resistencias antimicrobianas, en pacientes internados en la unidad de cuidados intensivos (UCI) durante la pandemia y compararlas con el período 2018- 2019 (pre-pandemia).

Materiales y métodos

Se analizaron de manera retrospectiva y observacional 223 muestras respiratorias obtenidas por lavado broncoalveolar (BAL) y aspirado traqueal (AT) de 142 pacientes internados en la UCI (Junio 2018 a Junio 2019) y 745 muestras de 358 pacientes internados en la UCI durante la pandemia por COVID-19 (Junio 2020 a Junio 2021) 537 muestras de 246 pacientes con COVID-19 y 208 muestras de 112 pacientes sin COVID- 19– atendidos en el Hospital de Clínicas.
Las muestras fueron procesadas siguiendo las recomendaciones del manual de procedimientos de nuestro laboratorio. Se consideró significativo un recuento ≥10 5 UFC/ml-AT y ≥10 3 UFC/ml-BAL, para cada microorganismo. Solo se consideraron aislamientos que no se repitieron dentro de los primeros 15 días. La identificación se realizó mediante espectrometría de masa.
Las resistencias índice consideradas fueron: carbapenemes en Enterobacterales(ERC) y Pseudomonas aeruginosa (Pae-RC);colistina en ERC (ERC-RCol) y Acinetobacter baumannii (Aba-RCol);meticilina en Staphylococcus aureus (SAMR).El antibiograma fue realizado mediante el equipo automatizado Phoenix. Se determinó la presencia de mecanismos de resistencia (KPC,NDM) mediante biología molecular. Para el análisis estadístico se utilizó el software RStudio. Los intervalos de confianza (IC95 de Wilson) fueron estimados mediante el método score Ralph Scherer 2018 y los resultados se consideraron significativos si no se observó superposición en los IC.

Resultados

En la pre-pandemia el porcentaje de muestras con desarrollo fue significativamente mayor 90%que en la pandemia 79%. La frecuencia relativa (FR) de las principales bacterias aisladas en los periodos pre- pandemia/pandemia fue: A. baumannii (31%/34%),P. aeruginosa (20%/18%),K. pneumoniae (12%/20%),S. aureus (8%/5%), P. mirabilis (7%/2%) y P. stuartii (0,01%/6%). En la pandemia fueron significativos los aumentos de K.pneumoniae y P. stuartii; y la disminución de P. mirabilis .

Se observó un aumento significativo en las resistencias índice en pre pandemia/pandemia en Aba-RCol (13% vs 35% y en ERC (21% vs 66%) y también para las carbapenemasas tipo KPC y NDM (21% vs 46% y 0% vs 19% respectivamente).