Introducción:
Con el establecimiento de la pandemia provocada por el virus SARS-CoV2, el diagnóstico molecular se volvió una herramienta fundamental en el manejo de la enfermedad COVID-19. Además, surgió la necesidad de un diagnóstico certero cuando se descartaba la infección por SARS-CoV2 y los pacientes cursaban una enfermedad respiratoria con perfil infeccioso viral. Por ello, la utilización de técnicas moleculares avanzadas que incluyen paneles de detección de amplio espectro microbiológico ayudan no solo a confirmar o descartar el SARS-CoV2, sino que también poseen la capacidad de realizar un diagnóstico diferencial para visualizar que otros virus y/o bacterias pueden ser responsables de la enfermedad.
Objetivos:
Estudiar mediante una técnica molecular avanzada la circulación del SARS-CoV2 y otros virus respiratorios durante la pandemia del COVID-19.
Materiales y Métodos:
Se estudiaron mediante métodos moleculares 30.939 muestras respiratorias de pacientes que presentaban síntomas gripales y/o habían tenido contacto estrecho con casos positivos para SARS-CoV2 desde septiembre del 2020 hasta agosto del 2021. 256 de las 30.939 muestras (120 mujeres, 136 hombres, edad promedio 41 años, rango etario 0 a 92 años) fueron analizadas utilizando el panel respiratorio Biofire FilmArray RP2.1 (FA), con criterio de urgencia diagnóstica. El FA puede detectar en 45 minutos mediante una PCR múltiple, 18 virus y 4 bacterias causantes de síndromes respiratorios cuyas presentaciones clínicas son similares.
Resultados:
De las 256 muestras analizadas con FA, 168 fueron negativas, 43 (16,8%) fueron positivas para SARS-CoV2, 37 (14,5%) para Rino/Enterovirus, 5 (2%) para Coronavirus HKU1, 4 (1,6%) para Parainfluenza 4, 3 (1,2%) para Coronavirus NL63, 2 (0,8%) para Coronavirus OC43 y 1 (0,4%) para Parainfluenza 2. Entre estos se observaron casos de coinfección, 3 (1,2%) positivas para SARS-CoV2 y Rinovirus, 2 (0,8%) para Rino/Enterovirus y Parainfluenza 4, 1 (0,4) para Rino/Enterovirus y Parainfluenza 2, 1 (0,4) para Coronavirus OC43 y Adenovirus y 1 (0,4%) para Rino/Enterovirus y Coronavirus HKU1.
Discusión / Conclusiones:
Con la utilización del FA se pudo observar que Rino/Enterovirus fue el virus más frecuente después de SARS-CoV2 y el mayoritario en coinfecciones. Esto resalta, la importancia de su diagnóstico por sobre otros virus. Además, mediante FA se logró realizar un diagnóstico rápido y certero de las infecciones virales bajo sospecha clínica más allá del SARS-CoV2.
