La vigilancia activa de SARS-CoV-2 es un objetivo esencial para el control de la enfermedad y la planificación gubernamental. En la mayoría de los casos las personas solo experimentan síntomas leves o son asintomáticos, siendo propagadores de la enfermedad, y dificultando la posibilidad de estimar la prevalencia en la comunidad. SARS-CoV-2 puede propagarse por la ruta fecal-oral, y el titulo viral en muestras de heces puede ser similar a la detectada por medio de las pruebas nasofaríngeas. Por lo tanto, la eliminación del virus en las heces ofrece una oportunidad única para rastrear el patógeno en las comunidades conectadas a un sistema municipal de aguas residuales. Muchos centros urbanos son atendidos solo por 1 o 2 empresas de tratamiento centralizadoras, proporcionando una única señal integrada de hasta millones de personas en solo unas pocas muestras. Nuestro objetivo fue utilizar este enfoque para medir la presencia viral en la población a partir de aguas residuales, así como sentar las bases de una posible vigilancia, que podría usarse como una herramienta de alerta temprana para prevenir a las comunidades sobre nuevas infecciones por COVID-19. Desde mayo del 2020 se realiza el monitoreo semanal del efluente cloacal que ingresa a la Estación Depuradora de Aguas Residuales. En cada campaña se obtiene una muestra compensada a partir de 24 alícuotas de efluente tomadas cada una a intervalos horarios, con un volumen proporcional al caudal de ingreso en la planta durante un día completo, utilizando para ello un muestreador automático. Las muestras se concentran, se realiza la extracción del RNA total y la amplificación del RNA viral por medio de la técnica de PCR en tiempo real, detectando el gen ORF1ab de SARS-CoV-2 y β-actina humana como control interno. La detección del virus se inició a partir la semana epidemiológica 28 del año 2020, durante la restricción total de circulación. El pico de casos fue en la semana epidemiológica 37, con 2500 casos confirmados, permitiendo anticipar el pico de aumento de números de casos. Adicionalmente, las muestras de aguas residuales portadoras de título viral detectadas por medio RT-PCR no se desarrollaron en cultivo, coincidiendo con otros reportes de estudios de efluentes en nuestro país. El monitoreo de efluentes residuales es una herramienta adecuada para la prevención de brotes de COVID-19.