Introducción:
La proteómica y la genómica han tenido un rol significativo en el descubrimiento de nuevas especies de impacto clínico.
Descripción del Caso/Casos:
La proteómica y la genómica han tenido un rol significativo en el descubrimiento de nuevas especies de impacto clínico. El objetivo del presente trabajo fue describir 3 casos de infecciones graves por Phytobacter spp. Métodos: Los aislados fueron identificados por metodología convencional, espectrometría de masas (MALDI TOF, Bruker) y por secuenciación de genoma completo (WGS) utilizando un secuenciador Illumina MiSeq. La sensibilidad antibiótica fue realizada por el sistema VITEK 2C (bioMérieux). Presentación de los casos clínicos Caso 1: paciente sexo femenino, 85 años con cáncer de mama y metástasis pulmonar en tratamiento quimioterápico y antecedentes de internaciones previas, ingresó con un cuadro de fiebre, episodio sincopal, disnea y tos productiva que se interpretó como una neumonía intrahospitalaria. En el hisopado rectal (búsqueda KPC) se aisló una enterobacteria identificada como Phytobacter diazotrophicus (WGS) con 3 genes de resistencia adquirida: blaSHV-12, bla KPC-2, localizado en un trasposon (Tn4401) y, blaqnrE, responsable de la resistencia a quinolonas. Caso 2: sepsis fulminante en neonato prematuro de embarazo extra membranoso que requirió resucitación cardiopulmonar e intubación endotraqueal desde el momento del nacimiento, Recibió nutrición parenteral total durante 14 días. Presentó inestabilidad clínica y hemodinámica. De 2 hemocultivos se aisló Phytobacter ursingii (WGS) solo resistente a ampicilina (AMP). La paciente fue tratada con AMP + gentamicina con mala evolución clínica y falleció. Caso 3: paciente sexo masculino, 78 años, con antecedentes de hiperplasia benigna de próstata, que presentó fiebre y escalofríos después de 10 días tras una prostatectomía. En el urocultivo y hemocultivos se aisló Phytobacter diazotrophicus (WGS) resistente a AMP. El cuadro fue interpretado como una sepsis a foco urinario. El paciente fue tratado con piperacilina-tazobactam y ciprofloxacina con buena evolución clínica. No se detectaron genes de resistencia adquirida a antibióticos en los casos 2 y 3. La identificación fenotípica de los 3 aislados fue compatible con Enterobacter agglomerans no pigmentado y productor de Indol; la identificación por MALDI TOF arrojó como resultado Cronobacter sp. (librería 9.0) y, como P. ursingii (caso 2) y Phytobacter sp. (casos 1 y 3) con la librería 12.0.
Discusión:
La emergencia de nuevos géneros de enterobacterales, ha planteado desafíos para el diagnóstico y el tratamiento de las infecciones relacionadas. En este sentido, la identificación correcta de Phytobacter spp. sigue siendo un desafío para los laboratorios de microbiología.
