La resistencia (R) a los antimicrobianos (RAM) es un problema global, considerado “one-health”, ya que afecta la salud humana(Hu)- animal(An)-ambiental. S. aureus (SA) coloniza e infecta tanto a Hu como a An, tiene capacidad de adquirir RAM, como R a meticilina (MRSA) y potencial de transmisión a través de clones de alto riesgo entre Hu (en el hospital, HA y la comunidad, CA), ambiente y An (LA), siendo los cerdos uno de los principales reservorios. Poco se conoce sobre MRSA en la producción de cerdos para consumo en Argentina
Nuestro objetivo fue analizar presencia, perfil de RAM y análisis genómico de cepas de MRSA en granjas porcinas de una región del centro del país.
En 2022, se tomaron 50 muestras de efluentes y de materia fecal en 10 granjas, 24/50 fueron positivas para MRSA en 8/10 granjas, y se recuperaron 41 aislamientos. Se realizó el antibiograma (difusión/Vitek2, CLSI2023). La caracterización molecular se realizó por PFGE/tspa/MLST/SCCmec. Se seleccionaron 24/41 aislamientos para el análisis genómico (Illumina-Novaseq6000): resistoma-filogenia. Se identificaron 3 linajes (CC), dos LA-MRSA predominantes: CC398: 53,7%, n:22: ST398 (41.5%, n:17, PFGE:ND, t034/t571, SCCmecV y ST8814 (12.2%, n:5, t571, SCCmecV y CC1/ST9: (41,5%, n: 17, PFGE:X3, 94,1% y X4, 5,9%, t16964/t13493, SCCmecV) y un CA-MRSA (en una granja): CC8/ST72: (4,8%, n:2, PFGE-R2, t3092, SCCmecIVa). Los LA-MRSA presentaron multi-RAM (R a > 3 familias de ATM), con R a SXT (56,4%), CMP (97,4%), CLI (100%), ERY (89,7%), CIP (97,4%), GEN (28,2%), TET y MIN (61,5%). El análisis genómico determinó que, además del gen mecA, portaron, los siguientes genes de R: Blactámicos(blaZ), macrólidos/lincosamidas/Strepto(ermC/T, lnuB, vgaA e lsaE, msr, mphC, vgaA), SXT(dfrG, dfrA), TET(tetK/M/L/T), aminoglucósidos(aadD, aacA-aphD, ant-6-(Ia), aph(3)-III, ant-(9)-Ia, str), Fenicoles(fexA, cat), bleomicina(bleO), Fosfomicina(fosB) y CIP(sustituciones en GyrA_S84L y ParC_S80F), concordancia completa con el fenotipo de R.
Se detectaron los dos linajes LA-MRSA más frecuentes globalmente: CC398 y CC1 con multi-RAM y un CA-MRSA-ST72/IVa, en el ambiente de las granjas porcinas analizadas en la región central del país con posibles eventos de transmisión entre ellas (<40 SNP de diferencia). Estos datos demuestran la importancia de los porcinos como reservorio de MRSA-multi-RAM y brindan información para evaluar estrategias de control para minimizar su diseminación.