Introducción:
El genotipo III o sudeste asiático-americano de DENV-2 es el que predomina actualmente en el continente americano. Durante 2019 se detectó la introducción del genotipo Cosmopolita en Perú y en 2021 se reportó un caso de este genotipo en Brasil. Se encuentra en investigación la asociación entre dicho genotipo con un mayor potencial de dispersión y aparición de formas más severas de la enfermedad en el continente americano. En Argentina entre agosto de 2021 y abril de 2022 se confirmaron 381 casos autóctonos de dengue (DENV-2 y DENV-1), de los cuales, 289 fueron detectados en 6 localidades de la provincia de Salta, correspondientes al serotipo 2.
Objetivos:
Caracterizar y genotipificar cepas de DENV-2 circulantes en la provincia de Salta 2021-2022.
Materiales y métodos:
Se seleccionaron 14 muestras de DENV-2 procedentes de la provincia de Salta obtenidas entre 2021 (3) y 2022(11) en base a valores de Ct y datos epidemiológicos. A partir del RNA extraído de los sueros se prepararon las bibliotecas utilizando el kit Ilumina COVID-Seq Assay con primers específicos para la generación del cDNA(Hill y col). La reacción de secuenciación se llevó a cabo en un equipo MiSeq (Ilumina) utilizando MiSeq Reagent kit v2 300-cycles. Los reads obtenidos fueron analizados mediante la aplicación Genome Detective Virus Tool v2.39 y corroborados mediante el software UniproUGENE v42.0 y la genotipificación se realizo mediante la herramienta web Dengue Virus Typing Tool v3.83
Resultados:
Se obtuvieron 10 secuencias genómicas con una cobertura global mayor al 80%. Dos muestras corresponden a pacientes con fecha de inicio de síntomas entre marzo y abril de 2021 de las localidades Tartagal y Santa Victoria Este y 8 al brote actual, obtenidas entre febrero y abril, de las localidades de Aguaray, Salvador Mazza y Santa Victoria Este. Todas las secuencias corresponden al genotipo III, resultando filogeneticamente más relacionadas con cepas de Brasil de 2018 y 2019. Todos los pacientes tuvieron una clínica compatible con dengue leve y 6 de ellos (en los que se disponía del dato) no requirieron hospitalización.
Discusión / Conclusiones:
Se detectó el genotipo III en todas las muestras estudiadas tanto del 2021 como 2022, sin detección hasta el momento en Argentina del genotipo cosmpolita recientemente introducido en el continente americano. Es fundamental continuar con los estudios de vigilancia genómica y la realización de análisis filogenéticos y estudios filodinámicos que permitirán contribuir al mejor entendimiento en la introducción y dispersión del dengue en Argentina.
