Introducción
Los rinovirus humanos (HRVs), pertenecientes a la familia Picornaviridae, son patógenos causantes de infecciones del tracto respiratorio superior e inferior. Se clasifican en tres especies, HRV-A, HRV-B y HRV-C, y en más de 100 genotipos que presentan una elevada diversidad genética.
Objetivo
Caracterizar la diversidad de especies y genotipos de HRVs circulantes en la ciudad de Santa Fe, durante 2010-2011.
Materiales y Métodos
Se estudiaron HRVs detectados mediante RT-PCR en aspirados nasofaríngeos de pacientes menores de 15 años, internados en hospitales de Santa Fe con infección respiratoria aguda.
La tipificación se basó en la amplificación de un fragmento de 542 pb por RT-PCR, conteniendo las regiones VP4/VP2, y en la secuenciación en ambas direcciones. La determinación de las especies se efectúo comparando las secuencias con otras depositadas en NCBI GenBank. Las reconstrucciones filogenéticas se realizaron por el método de Maximum likelihood.
Resultados
El porcentaje de positividad del HRV durante el período estudiado fue del 38% (172 muestras). Se utilizaron 52 muestras para el análisis filogenético: 34 (65.4%) fueron incluidas dentro de la especie HRV-A, 7 (13.5%) pertenecieron a la especie HRV-B, y 11 (21.1%) fueron clasificadas como HRV-C. Se identificaron 28 genotipos diferentes: 18 en la especie HRV-A, 4 en HRV-B y 6 en HRV-C.
Conclusiones
Las tres especies de HRVs, con una elevada diversidad de genotipos, circularon en niños hospitalizados con infección respiratoria aguda, durante 2010-2011 en la ciudad de Santa Fe. Se observó una predominancia de la especie HRV-A.